Код: 318122

Назва:

Геноміка

Анотація: дисципліна викладається для опанування студентами сучасних знань щодо геномів еукаріотів та прокаріотів. Включає характеристику структурних елементів геномів - унікальні та повторювані компоненти геномів, їхнє призначення та функціональне навантаження. Мобільні генетичні елементи та розмір геному. Методи аналізу геномів, секвенування геномів, генетичні та фізичні карти. Молекулярно-генетичні маркери, їхня класифікація та використання. Експресія генетичного матеріалу. Методи порівняння експресії: якісні і кількісні. Зв'язок між структурою і функцією генетичного матеріалу. Протеоміка, її зміст та завдання. Методи протеоміки. Зв'язок протеоміки з транскриптомом та метаболомом. Філогенетичні дослідження у геноміці та еволюція геномів. Методи порівняння генетичних текстів та мінливість геномів. Еволюція послідовностей нуклеотидів, еволюційні дерева.

Тип дисципліни: нормативна

Рік навчання: І

Семестр: осінній

Кількість кредитів: 5

Форма контролю: екзамен

Викладач(і): Антонюк М.З.,доктор біологічних наук, професор

Результати навчання: o Моделювати об'єкти і процеси у живих організмах та їхніх компонентах із використанням математичних методів й інформаційних технологій.
o Вміти правильно оцінювати актуальність розвитку окремих наукових напрямків і бачити риси інноваційності.
o Проявляти активну позицію у визначенні напрямків фахової діяльності, спираючись на здобуті фахові компетентності та знання у суміжних галузях.
o Мати навички у складанні та реалізації наукових проєктів, як фундаментальних, так і прикладних.
o Вільно володіти англійською мовою щодо спеціального контенту для усного спілкування та написання наукових текстів.



Спосіб навчання: аудиторний, дистанційний

Необхідні обовязкові попередні й супутні модулі: Біохімія, Генетика, Молекулярна біологія, Молекулярна біотехнологія, Генетика онтогенезу, Генетика мікроорганізмів

Зміст дисципліни: Структурна геноміка. Карти фізичні та генетичні. Методи секвенування геному. Класифікація нуклеотидних послідовностей. ДНК поліморфізми, їхнє використання для складання карт. Функціональна геноміка. Бібліотеки кДНК. Анотація геному. Транскриптом, інтерактом. Роль мікроматриць у геноміці. Протеоміка. Феном. Взаємодія геному і середовища. Еволюційна геноміка. Молекулярна еволюція геномів і генів. Алгоритми порівняння геномних послідовностей, інструментальне значення.


Рекомендована література: 1.Сингер М., Берг П., Гены и геномы. Тт. 1,2. 377 с., 394 с. М, Мир, 1998.
2. Watson J., et al. Molecular biology of the gene. 2003.
3. Hartwell L., et al. Genetics from gene to genomes. McGrowHill, 2011. 817 p.
4. Brown T.A. Genomes. 2nd ed. www.ncbi.nlm.nih.gov
5. Strachan T. Human molecular genetics. 2nd ed.www.ncbi.nlm.nih.gov
6. Lewin B. Gene. 9th ed.Bartlett publ., 2008. 909 p.
7. Lesk A. Introduction to genomics 2 ed. - Oxford university press, 2012. 420 p.
8. van Straalen Nico M., Roelofs Dick An Introduction to Ecological Genomics. Oxford university press, 2006. 316 p.
9. Watson J., et al. Molecular biology of the gene. 7th ed. Pearson, 2014. 911 p.
Рейтингові міжнародні журнали-2010-наш час:
1. Molecular Genetics and Genomics (MGG), Springer
2. Genomics, Elsevier
3.TAG, Springer
4. PNAS
5. Genetics, USA
6. Chromosoma, Springer


Форми та методи навчання: лекції (22 год.), семінарські заняття (22 год.), лабораторно-практичні заняття (4 год.), самостійна робота (102 год.)

Методи й критерії оцінювання: поточний контроль 70 %; підсумковий контроль (екзамен) - 30 %.

Мова навчання: українська